Architecture x86_64

Logiciels sur l'architecture x86_64 sans GPU

Liste en cours de rédaction

Gaussian

L'utilisation de Gaussian 16 est soumise à autorisation. Il n'est pour le moment disponible que sur architecture x64 sans GPU. Pour demander un accès à Gaussian, créez un ticket sur le système de ticket ROMEO dans la catégorie 'Autre demande technique'.

Gaussian étant un peu particulier à utiliser, il n'a pas été intégré à Spack pour le moment, cela viendra dans un second temps, cette documentation sera mise à jour en conséquence

Pour utiliser Gaussian 16, voici un exemple de fichier de soumission Slurm :

gaussian16_slurm_examplefile.sh
#!/usr/bin/env bash
#SBATCH --account="mon_code_projet"
#SBATCH --time=1-02:30:00
#SBATCH --mem=16G
#SBATCH --constraint=x64cpu
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --cpus-per-task=16
#SBATCH --job-name "GaussianTest"

romeo_load_x64cpu_env

spack load pgi@18.10

#Je définie ou se trouve Gaussian dans mon environnement
export PATH=/apps/2025/manual_install/gaussian/g16/:$PATH
export g16root=/apps/2025/manual_install/gaussian/

#Je dis a Gaussian quel dossier utiliser pour ses fichiers temporaires de travail, ici dans un dossier portant le numéro du job dans notre scratch_p
export GAUSS_SCRDIR="/scratch_p/$USER/Gaussian/$SLURM_JOB_ID"

#J'ajoute Gaussian dans mon environnement
source /apps/2025/manual_install/gaussian/g16/bsd/g16.profile

#Je créer le dossier de travail temporaire définie plus haut
mkdir -p $GAUSS_SCRDIR

#Je donne le fichier d'Input
inputfile="Test-Water.gjf"

#Je lance le calcul, en redirigeant la sortie de gaussian dans un fichier dédié
echo "========================"
echo "Lancement du calcul, output dans gaussian.output.$SLURM_JOB_ID.txt :"
g16 < $inputfile > gaussian.output.$SLURM_JOB_ID.txt

#J'affiche le contenu du dossier temporaire, normalement redevenu vide
echo "========================"
echo "Verification de le dossier temporaire est bien vide apres le job :"
ls -l $GAUSS_SCRDIR

#Je supprime le contenu du dossier temporaire, ne fonctionne que si il est vide, sinon ne supprime pas
echo "========================"
echo "Suppression du dossier temporaire si il est vide :"
rmdir $GAUSS_SCRDIR

Gaussian​

Gaussian